More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3577 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  65.79 
 
 		 647 aa  914    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  67.03 
 
 		 647 aa  940    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  65.95 
 
 		 647 aa  914    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  65.43 
 
 		 645 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 648 aa  1343    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.5 
 
 		 642 aa  364  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.52 
 
 		 643 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.72 
 
 		 640 aa  342  8e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.77 
 
 		 639 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  32.11 
 
 		 639 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.27 
 
 		 644 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  33.02 
 
 		 811 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  34.74 
 
 		 482 aa  134  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  29.52 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  34.76 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  31.01 
 
 		 551 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  31.35 
 
 		 508 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  33.18 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  31.15 
 
 		 523 aa  127  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  30.52 
 
 		 506 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  30.05 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  30.05 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  27.38 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  31.96 
 
 		 546 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  29.05 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  28.29 
 
 		 552 aa  91.3  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  30.58 
 
 		 589 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  28.02 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  26.19 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  29.3 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.15 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  27.59 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  26.19 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  28.97 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  26.69 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.23 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  30 
 
 		 473 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.39 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  25.4 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  29.39 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  30.15 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.77 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  30.04 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.9 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  25 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  29.17 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.11 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.51 
 
 		 448 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  28.84 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.6 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  27.8 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.46 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.64 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  28.79 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  24.71 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.51 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  27.16 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.54 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  26.54 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  26.86 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  25.36 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  26.05 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  26.05 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25.78 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  39.56 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  46.27 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  28.5 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  41.11 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.06 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  54 
 
 		 130 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  54 
 
 		 130 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25.99 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.48 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  44.71 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  44.71 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  44.71 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.92 
 
 		 130 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  36.84 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.82 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45.9 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  25.71 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.58 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  39.56 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0624  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  55 
 
 		 173 aa  60.1  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.28707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 397 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  38.46 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  44.62 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  24.31 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  35.16 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.43 
 
 		 148 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  47.27 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  30.52 
 
 		 989 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  33.33 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  41.89 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  34.07 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 		 472 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>