More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0205 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
148 aa  303  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.78 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  38.1 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.28 
 
 
139 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  48.15 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
640 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.81 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  30 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  51.67 
 
 
63 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 
510 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.74 
 
 
642 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.33 
 
 
639 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.5 
 
 
643 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  29.41 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  29.29 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  60.42 
 
 
512 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  48.61 
 
 
526 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  42.86 
 
 
217 aa  70.1  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  33.56 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.13 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 
592 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.11 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  47.76 
 
 
531 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.87 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  46.67 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
504 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.59 
 
 
178 aa  67  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.61 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
520 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.21 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  58.14 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.29 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  55.81 
 
 
525 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  48.28 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  55.81 
 
 
525 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  55.32 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  45.45 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  31.34 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
508 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.19 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  56.25 
 
 
499 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.61 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  43.06 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.19 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
508 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  30 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 
513 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  43.55 
 
 
521 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  47.37 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  29.41 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46.88 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  41.03 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1458  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.01 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.562172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  54.55 
 
 
508 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 
513 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  54.55 
 
 
508 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 
521 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  32.58 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.32 
 
 
227 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
178 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  50 
 
 
179 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  27.14 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0488  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.32 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.32 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.32 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.32 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  61.54 
 
 
504 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  31.06 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  52.27 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  47.69 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.62 
 
 
644 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  46.43 
 
 
524 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1649  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.32 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.670626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
513 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  52.38 
 
 
435 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2405  Rieske Fe-S protein  30.38 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.87 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.87 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 
508 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1553  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 
168 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.86 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.07 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
507 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
503 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
499 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 
516 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>