240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55102 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  100 
 
 		 589 aa  1212    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  58.35 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  56.93 
 
 		 479 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  57.7 
 
 		 475 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  57.27 
 
 		 475 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  58.52 
 
 		 459 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.38 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  54.39 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  54.92 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  54.2 
 
 		 479 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  54.6 
 
 		 465 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  53.63 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  54.39 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  56.46 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  56.05 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  54.18 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  54.7 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  54.91 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  53.81 
 
 		 477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  47.87 
 
 		 624 aa  503  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  49.53 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  52.05 
 
 		 599 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  38.51 
 
 		 463 aa  326  9e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  36.24 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  35.81 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  35.91 
 
 		 453 aa  320  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  36.46 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  34.62 
 
 		 455 aa  310  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  36.03 
 
 		 453 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  34.06 
 
 		 453 aa  301  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  36.03 
 
 		 460 aa  298  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  34.99 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  35.67 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  34.74 
 
 		 461 aa  283  9e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  34.53 
 
 		 460 aa  280  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  33.86 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  33.41 
 
 		 459 aa  264  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  35.29 
 
 		 488 aa  263  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  33.6 
 
 		 484 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 		 484 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  34.08 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  33.61 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33 
 
 		 486 aa  257  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  32.52 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.69 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.72 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.72 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  31.59 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  31.55 
 
 		 479 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  31.74 
 
 		 482 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  32.37 
 
 		 478 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  30.99 
 
 		 483 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  34.38 
 
 		 490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  32.06 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  29.91 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.97 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.14 
 
 		 477 aa  123  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.61 
 
 		 503 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.42 
 
 		 500 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.47 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  24.3 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.38 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.38 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.38 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.6 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.43 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.4 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  24.02 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  25.22 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.21 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  29.21 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.98 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  24.22 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  25.33 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  25.57 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  29.8 
 
 		 645 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  25.57 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  22.58 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  24.06 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  24.13 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.58 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  21.89 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.55 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  28.3 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  24.28 
 
 		 569 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  25.29 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.74 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  24.22 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  25.89 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  31.71 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  23.16 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  22.65 
 
 		 429 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.26 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  24.74 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  24.4 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  23.86 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  22.77 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  22.77 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>