More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2794 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  886    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  54.35 
 
 
439 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  52.79 
 
 
448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  51.16 
 
 
448 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  36.2 
 
 
436 aa  273  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  32.87 
 
 
429 aa  242  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  29.72 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  30.5 
 
 
436 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  30.28 
 
 
453 aa  189  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  29.57 
 
 
428 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  29.31 
 
 
412 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  30.21 
 
 
419 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  31.97 
 
 
410 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  28.2 
 
 
450 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  29.14 
 
 
414 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  26.57 
 
 
448 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  29.45 
 
 
437 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  28.05 
 
 
432 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  27.96 
 
 
450 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  28.83 
 
 
427 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  28.86 
 
 
412 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  25.92 
 
 
423 aa  150  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  29.19 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  26.56 
 
 
437 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  25.84 
 
 
437 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  28.44 
 
 
409 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  24.19 
 
 
445 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  24.19 
 
 
445 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  24.19 
 
 
445 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.37 
 
 
464 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.26 
 
 
459 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  21.32 
 
 
456 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  22.87 
 
 
502 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  22.65 
 
 
589 aa  60.1  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  22.87 
 
 
502 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.12 
 
 
462 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.99 
 
 
465 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.98 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  24.14 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.29 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.92 
 
 
511 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  25.31 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  24.61 
 
 
524 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  21.35 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  22.93 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  27.24 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.42 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.76 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.38 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  39.33 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  22.56 
 
 
477 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.13 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  38.46 
 
 
624 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  27.67 
 
 
500 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.76 
 
 
466 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  26.9 
 
 
469 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  22.34 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  42.67 
 
 
500 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  22.08 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.48 
 
 
647 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  25.48 
 
 
647 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
722 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  37.5 
 
 
472 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  21.45 
 
 
482 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  37.18 
 
 
647 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  25.77 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  71.05 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  24.32 
 
 
425 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  27.12 
 
 
479 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  34.62 
 
 
599 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  47.06 
 
 
501 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  26.83 
 
 
486 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  32.81 
 
 
488 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  40.79 
 
 
472 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.74 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  25.31 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  45.1 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.36 
 
 
438 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  32.81 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  41.18 
 
 
488 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  65.79 
 
 
500 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  34.25 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  39.19 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.08 
 
 
503 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  39.19 
 
 
453 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  38.96 
 
 
511 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  32.91 
 
 
410 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  42.67 
 
 
500 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  63.16 
 
 
598 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.69 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  35.9 
 
 
645 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  37.84 
 
 
455 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.18 
 
 
483 aa  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  37.5 
 
 
472 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.76 
 
 
653 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  63.16 
 
 
500 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1552  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.79 
 
 
646 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  23.83 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>