263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2356 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  68.3 
 
 		 484 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  75.2 
 
 		 486 aa  803    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  64.99 
 
 		 479 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  65.07 
 
 		 479 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  65.7 
 
 		 490 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  91.6 
 
 		 488 aa  932    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  100 
 
 		 488 aa  1010    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  68.03 
 
 		 499 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  72.96 
 
 		 481 aa  723    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  66.67 
 
 		 482 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  77.87 
 
 		 478 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  64.32 
 
 		 483 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  65.7 
 
 		 490 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  64.54 
 
 		 489 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  68.1 
 
 		 484 aa  726    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  68.92 
 
 		 484 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  75.2 
 
 		 486 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  83.67 
 
 		 490 aa  842    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  53.11 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  34.85 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  34.02 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  34.1 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  33.68 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  32.85 
 
 		 453 aa  276  8e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  32.85 
 
 		 453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  35.08 
 
 		 472 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  35.68 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  35.27 
 
 		 475 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  34.62 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  33 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.26 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  33 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  34.69 
 
 		 589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  32.86 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.43 
 
 		 474 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  34.78 
 
 		 471 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  32.66 
 
 		 466 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  33.81 
 
 		 479 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  35.52 
 
 		 477 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  33.13 
 
 		 472 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  31.44 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.06 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  33.61 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.54 
 
 		 459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 462 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.2 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  33.12 
 
 		 460 aa  233  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  33.05 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  31.8 
 
 		 624 aa  223  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.7 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  34.25 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  31.97 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  32.11 
 
 		 462 aa  216  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  31.97 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  31.77 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  24.24 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24.84 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.78 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.08 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.97 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.72 
 
 		 447 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  23.9 
 
 		 520 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.6 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  22.72 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  22.72 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  22.72 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  22.34 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.64 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.08 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  25.11 
 
 		 811 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.19 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  25.05 
 
 		 989 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  26.33 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  26.67 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  26.67 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  22.41 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  23.13 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  23.51 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  24.46 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  26.14 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.44 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.95 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.09 
 
 		 647 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.5 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  24.72 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25.76 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.68 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  26.88 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  24.32 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  25.83 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  26.37 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  23.34 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  28.88 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  25.47 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  23.01 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  25.1 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  35.16 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  25.15 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>