211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0877 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  72.93 
 
 		 459 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  76.91 
 
 		 462 aa  740    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  79.13 
 
 		 461 aa  756    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  84.1 
 
 		 461 aa  794    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  73.8 
 
 		 460 aa  732    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 460 aa  954    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  82.42 
 
 		 462 aa  771    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  38.83 
 
 		 471 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.01 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  37.61 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  37.23 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  38.39 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  37.86 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.93 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  38.18 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  35.43 
 
 		 589 aa  300  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  35.98 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  37.28 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  35.62 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  35.41 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.65 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  36.7 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  35.06 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  35.06 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  37.5 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  34.76 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  35.06 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  34.63 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  36.02 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.56 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  34.77 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  35.22 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  35 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  32.99 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  34.25 
 
 		 552 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  35.91 
 
 		 472 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  31.73 
 
 		 624 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.06 
 
 		 489 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.93 
 
 		 490 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.93 
 
 		 490 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  31.95 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.97 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  32.31 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.74 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  31.49 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  31.96 
 
 		 486 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  31.69 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  32.92 
 
 		 488 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  31.07 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  32.38 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  31.75 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  30.25 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  31.72 
 
 		 479 aa  219  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  30.63 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  32.14 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  28.86 
 
 		 591 aa  183  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.91 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.64 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  24.24 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  24.24 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  24.24 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.58 
 
 		 447 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.66 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.17 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24 
 
 		 503 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.54 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.11 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.97 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.66 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.04 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  28.21 
 
 		 647 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  20.85 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.71 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  22.75 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  22.34 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  22.52 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  22.52 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  23.67 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.15 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  22.61 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  22.88 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  24.83 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  22.27 
 
 		 989 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.46 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  22.95 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  23.32 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 609 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  25.78 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  21.58 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  22.26 
 
 		 523 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.7 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  21.52 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 473 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  20.52 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  22 
 
 		 418 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  29.1 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.35 
 
 		 454 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  24.26 
 
 		 544 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  20.87 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.17 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>