252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1283 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  70.09 
 
 		 459 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 462 aa  951    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  77.66 
 
 		 461 aa  741    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  76.62 
 
 		 462 aa  734    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  76.91 
 
 		 460 aa  743    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  71.24 
 
 		 460 aa  717    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  77.85 
 
 		 461 aa  746    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  38.48 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  36.95 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  36.64 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.88 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.44 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  37.83 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  35.62 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  37.61 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  37.66 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  36.54 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  35.29 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  37.64 
 
 		 477 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  35.36 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  34.01 
 
 		 453 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  35.93 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.99 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  35.93 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  36.74 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  36.96 
 
 		 472 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  35.32 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  35.5 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  35.64 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  36.52 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.71 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  36.42 
 
 		 472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  34.62 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  34.8 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  34.05 
 
 		 464 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.83 
 
 		 599 aa  279  7e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  32.37 
 
 		 624 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.81 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  33.06 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  32.58 
 
 		 486 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  32.37 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.99 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.99 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  32.64 
 
 		 484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  32.44 
 
 		 499 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  32.3 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  32.29 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  31.81 
 
 		 483 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  31.87 
 
 		 482 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  31.73 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  32.99 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  31.82 
 
 		 479 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  32.36 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  30.06 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  31.97 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  27.51 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.45 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  28.54 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.44 
 
 		 447 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.16 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.16 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.16 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.82 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.2 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.5 
 
 		 500 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.86 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.33 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  25.32 
 
 		 506 aa  89.7  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.02 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  22.27 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.97 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.43 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.43 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  24.94 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.43 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  25.11 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.21 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.57 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.84 
 
 		 647 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.98 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.81 
 
 		 647 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  22.75 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.26 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  26.01 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  23.53 
 
 		 989 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  24.28 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  29.31 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  26.25 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  26.25 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.8 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 609 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  28 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.24 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  22.77 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  26.74 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  24.73 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  23.26 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  27.22 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>