More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3962 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 989 aa  2046    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  44.23 
 
 		 565 aa  442  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  39.82 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  39.82 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  39.82 
 
 		 594 aa  413  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  38.23 
 
 		 355 aa  194  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.26 
 
 		 343 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 327 aa  164  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  35.74 
 
 		 349 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  25.77 
 
 		 972 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.35 
 
 		 339 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  25.77 
 
 		 972 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  25.77 
 
 		 972 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.74 
 
 		 323 aa  155  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 349 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 349 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.05 
 
 		 325 aa  154  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  32.23 
 
 		 322 aa  154  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  37.33 
 
 		 330 aa  152  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 313 aa  152  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  34.56 
 
 		 322 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  34.38 
 
 		 322 aa  151  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  33.53 
 
 		 322 aa  151  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 341 aa  151  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  33.83 
 
 		 358 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  36 
 
 		 327 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 327 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.88 
 
 		 338 aa  150  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.63 
 
 		 323 aa  150  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  32.94 
 
 		 332 aa  149  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  32.94 
 
 		 332 aa  149  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  34.23 
 
 		 322 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.09 
 
 		 322 aa  148  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.19 
 
 		 323 aa  148  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 344 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 		 323 aa  147  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.42 
 
 		 323 aa  147  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  35 
 
 		 337 aa  147  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.14 
 
 		 322 aa  146  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.5 
 
 		 340 aa  146  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  35.43 
 
 		 360 aa  146  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  31.38 
 
 		 348 aa  146  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  34.73 
 
 		 323 aa  145  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 351 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  33.73 
 
 		 325 aa  145  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.5 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.72 
 
 		 324 aa  145  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  35.79 
 
 		 319 aa  145  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 322 aa  145  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.11 
 
 		 336 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  35.43 
 
 		 349 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  31.7 
 
 		 320 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 335 aa  144  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 322 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 322 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  33.97 
 
 		 323 aa  144  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  36.33 
 
 		 334 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.44 
 
 		 324 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  36.93 
 
 		 327 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 322 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.9 
 
 		 323 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 322 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  32.39 
 
 		 322 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  33.97 
 
 		 323 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  37.78 
 
 		 336 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  37.78 
 
 		 336 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  37.45 
 
 		 336 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  33.97 
 
 		 323 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 		 359 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  38.17 
 
 		 344 aa  142  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  34.75 
 
 		 336 aa  141  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  36.44 
 
 		 327 aa  141  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 		 323 aa  141  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 370 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 370 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  31.54 
 
 		 317 aa  140  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 370 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 370 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 370 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 327 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 345 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.17 
 
 		 336 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 322 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 		 323 aa  140  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  35.25 
 
 		 322 aa  140  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  37.33 
 
 		 336 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  32 
 
 		 313 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  32.2 
 
 		 322 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.01 
 
 		 336 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  33.12 
 
 		 323 aa  140  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  32.21 
 
 		 337 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.69 
 
 		 332 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.22 
 
 		 334 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  33.33 
 
 		 342 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.26 
 
 		 337 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  32.94 
 
 		 325 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.63 
 
 		 333 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.8 
 
 		 323 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>