More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0088 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 325 aa  658    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  82.66 
 
 		 325 aa  521  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0799  octaprenyl-diphosphate synthase  50.47 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.286745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  39.18 
 
 		 336 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  39.44 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  39.18 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  39.31 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  40.13 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  40 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  38.05 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 340 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  36.92 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  40.06 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  39.56 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  37.61 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  38.59 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  37.46 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 351 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  35.35 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  35.65 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.58 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.78 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  37.15 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  37.46 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  39.37 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.83 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36.07 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  39.37 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  39.37 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.74 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  36.45 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.74 
 
 		 322 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  38.72 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 338 aa  235  9e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.74 
 
 		 322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.99 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  38.8 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  37.06 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  37.06 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  37.06 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.96 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.26 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  35.85 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.69 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.16 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.05 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.65 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.05 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  37.78 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  37.96 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  36.6 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  42.21 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.22 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  39.11 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.53 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.6 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.97 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  37.96 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  36.69 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  36.93 
 
 		 323 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  41 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  36.92 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  38.49 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  36.05 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  34.75 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.39 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  37.71 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  34.28 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.12 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  37.94 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>