More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5713 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  100 
 
 		 355 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  38.23 
 
 		 989 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  41.82 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  41.19 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  42.57 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  41.16 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  41.16 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  40.27 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.54 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  41.02 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  38.32 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  40.77 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  38.18 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  39 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.93 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.91 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  38.71 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  41.98 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35.37 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  36.79 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  39.53 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  42.01 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  36.43 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.05 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  38.57 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  34.85 
 
 		 326 aa  165  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  35.05 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  38.93 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  38.93 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  44.5 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  39.16 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  36 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  36.63 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  38.93 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  38.93 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  37.17 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  38.13 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  34.44 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  38.46 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  39.16 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  38.81 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.99 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  37.42 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  39.67 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  38.74 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  32.61 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  37.41 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  37.88 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  36.54 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.44 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 336 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  34.26 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  34.92 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  38.36 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.96 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  37.5 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.5 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.13 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.89 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 337 aa  156  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  37.5 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  33.92 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  35.79 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  36.08 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.15 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  39.13 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  36.12 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.97 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  36.64 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  38.23 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>