More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3230 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 327 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  43.48 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.3 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  39.3 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  38.17 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  40.88 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  40.95 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  37.58 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  37.06 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  40.76 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  38.98 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  39.56 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  39.87 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  37.58 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  39.68 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  38.34 
 
 		 335 aa  222  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  38.17 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  37.26 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  40.38 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.49 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  37.06 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.54 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.34 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  38.36 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.91 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.26 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  39.12 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  38.44 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  37.3 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  38.44 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  36.83 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  38.44 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  40.88 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  37.97 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  37.23 
 
 		 360 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  37.85 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  37.26 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  35.62 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  39.43 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  39.43 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  35.62 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.74 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  36.65 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  37.82 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  36.34 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  36.02 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  35.65 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  37.18 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.66 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  35.33 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.39 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  38.97 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  42.23 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  40.89 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  34.16 
 
 		 324 aa  202  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  35.99 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  35.99 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  35.99 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  35.99 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  35.99 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  37.17 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  36.25 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  37.06 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  36.22 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  38.36 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  37.91 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  41.6 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>