More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1586 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 323 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  50.78 
 
 		 322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  48.9 
 
 		 322 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  48.28 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  49.53 
 
 		 322 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  47.95 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  47.48 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  45.62 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  45.86 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  43.73 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  45.45 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  42.63 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  42.95 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  42.59 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  43.77 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  42.63 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  43.35 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  43.77 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  43.26 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  43.89 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  43.13 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  43.17 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  44.19 
 
 		 322 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  43.26 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  43.45 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.81 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  44.19 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  44.69 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  44.97 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  43.12 
 
 		 370 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  45.74 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  44.19 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  43.12 
 
 		 370 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  43.12 
 
 		 370 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  43.12 
 
 		 370 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  43.12 
 
 		 370 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.49 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  45.15 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  44.09 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  43.71 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  43.45 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  41.07 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  41.07 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  43.81 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  40.75 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  44.51 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  41.88 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  44.51 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  41.53 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  41.88 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  41.94 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  41.56 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  40.44 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  43 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  43.29 
 
 		 359 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  43.26 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  41.48 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  42.49 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.62 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 341 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  43.89 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  39.18 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  39.81 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  43.57 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  41.56 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  42.12 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  41.07 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  42.9 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  41.56 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  42.9 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  41.85 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  41.48 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  40.13 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  41.25 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  41.93 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  42.38 
 
 		 342 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  43.73 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  41.93 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>