More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0054 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 358 aa  715    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  68.17 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  60.93 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  58.28 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  55.62 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  55.56 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  51.11 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  51.4 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  57.45 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  57.45 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  51.65 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  50.84 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  50.84 
 
 		 340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  57.45 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  53.57 
 
 		 339 aa  339  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  52.25 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  52.25 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  52.12 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  53.82 
 
 		 336 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  53.18 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  51.05 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  51.35 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  50.45 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  56.52 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  49.44 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  51.43 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  54.05 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  52.13 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  54.92 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  56.83 
 
 		 334 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  49.7 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  50.28 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  50 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  48.01 
 
 		 356 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  52.78 
 
 		 335 aa  305  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  48.01 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  49.24 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  48.79 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  53.18 
 
 		 322 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  47.4 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  47.87 
 
 		 323 aa  292  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  50.32 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  46.39 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  46.93 
 
 		 323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  48.16 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  47.56 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  47.56 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  47.56 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  47.85 
 
 		 323 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.62 
 
 		 324 aa  281  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  47.56 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  48.77 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  47.13 
 
 		 323 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  47.85 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  46.11 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  47.77 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  46.69 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.24 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  45.74 
 
 		 322 aa  275  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.74 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  48.41 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  45.99 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  44.51 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  45.86 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  45.99 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 323 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  47.24 
 
 		 323 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  47.24 
 
 		 323 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 323 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 323 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  47.26 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45.11 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  45.43 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  45.86 
 
 		 323 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  47.22 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  45.86 
 
 		 323 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  47.26 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  47.26 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  46.03 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  45.86 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  47.26 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  47.26 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  45.68 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  48.7 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  44.41 
 
 		 322 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  49.36 
 
 		 325 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  44.79 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  46.32 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>