More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1983 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 322 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  53.12 
 
 		 322 aa  348  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  52.65 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  52.5 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  53.44 
 
 		 322 aa  341  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  53.12 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  51.56 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  51.88 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  46.2 
 
 		 322 aa  288  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  49.05 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  47.91 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.82 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  47.91 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  47.59 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  45.57 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  47.59 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  46.95 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  45.86 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  49.67 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  46.62 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  44.69 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  46.01 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  45.4 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.18 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  44.72 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  46.2 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  45.77 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  47.97 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  47.97 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  43.04 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  44.24 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  44.3 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  46.95 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  45.08 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.01 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  45.86 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  42.59 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  45.54 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  44.38 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  44.38 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  44.38 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  43.99 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  44.38 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  43.95 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  44.74 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  44.9 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  44.19 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  45.31 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  44.59 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  42.36 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  45.09 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  43.49 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  44.87 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  43.65 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  47.41 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  45.48 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  43.49 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  41.27 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  44.87 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  42.04 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  48.51 
 
 		 359 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  50.39 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  44 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  45.17 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  45.17 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  42.41 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  46.3 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  45.17 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  46.3 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.01 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  52.52 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  44.3 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  44.76 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  43.17 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  41.46 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  43.17 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  41.08 
 
 		 323 aa  251  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  42.32 
 
 		 336 aa  251  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  43.04 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  42.77 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  41.59 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  43.04 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>