More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2362 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 
323 aa  648    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  70.81 
 
 
323 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  71.12 
 
 
323 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  69.25 
 
 
323 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  69.25 
 
 
323 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  68.42 
 
 
323 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  71.12 
 
 
323 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  67.08 
 
 
323 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  64.6 
 
 
323 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  65.22 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  65.53 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  63.04 
 
 
323 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.49 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.61 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.8 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.8 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.8 
 
 
323 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.8 
 
 
323 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  54.43 
 
 
311 aa  326  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  45.34 
 
 
325 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  43.3 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  40.7 
 
 
456 aa  249  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  45.28 
 
 
309 aa  249  6e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  48.33 
 
 
483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  43.48 
 
 
465 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  40.45 
 
 
333 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  38.94 
 
 
322 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.35 
 
 
320 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  39.81 
 
 
325 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.89 
 
 
322 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.76 
 
 
320 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  43.21 
 
 
323 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  40.77 
 
 
331 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  40.77 
 
 
331 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  40.77 
 
 
331 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  40.77 
 
 
331 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  41.81 
 
 
323 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  39.09 
 
 
325 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  40.13 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.28 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.68 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  40.77 
 
 
323 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.02 
 
 
320 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.8 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.38 
 
 
323 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.38 
 
 
323 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  36.92 
 
 
343 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.7 
 
 
320 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.02 
 
 
320 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.7 
 
 
320 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.49 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  38.01 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.38 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.02 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  36.88 
 
 
322 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.7 
 
 
320 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  40.83 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  36.88 
 
 
322 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.09 
 
 
322 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  40.83 
 
 
313 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  42.51 
 
 
323 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  42.51 
 
 
331 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  38.17 
 
 
330 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  38.41 
 
 
323 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  42.51 
 
 
331 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  40.42 
 
 
323 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  38.33 
 
 
323 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  42.16 
 
 
331 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  41.87 
 
 
331 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  39.94 
 
 
336 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.98 
 
 
322 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
323 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
323 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  37.92 
 
 
325 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.68 
 
 
331 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.62 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  40.21 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  38.33 
 
 
323 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.04 
 
 
332 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.44 
 
 
320 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  36.99 
 
 
322 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.81 
 
 
320 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  36.95 
 
 
322 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  37.98 
 
 
370 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  37.98 
 
 
370 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  37.98 
 
 
370 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  37.98 
 
 
370 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  37.98 
 
 
370 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  35.43 
 
 
319 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>