More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5067 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 334 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  75.15 
 
 		 334 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  59.75 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  59.38 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.49 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  60.44 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  60.42 
 
 		 344 aa  359  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  58.63 
 
 		 356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  55.05 
 
 		 338 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.78 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.93 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  54.49 
 
 		 351 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  55.93 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  55.14 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  54.91 
 
 		 338 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.6 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.66 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.9 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  48.95 
 
 		 366 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  50.45 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.42 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  47.98 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.76 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.47 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  48.5 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  47.35 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  52.5 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  48.5 
 
 		 343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  50 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.91 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  38.29 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.06 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  37.7 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.74 
 
 		 333 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  37.38 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.74 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.52 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.81 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.91 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  36.28 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  37.74 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.29 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  36.39 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  32.59 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.04 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.59 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.54 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.65 
 
 		 320 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.08 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  33.12 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  33.54 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.01 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.02 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.02 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  32.92 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.54 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  32.62 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.17 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.74 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.94 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  29.32 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  34.92 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  32.1 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  41.13 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.77 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  32.48 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>