More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1469 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  100 
 
 
323 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  86.07 
 
 
323 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  73.6 
 
 
323 aa  504  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  72.76 
 
 
323 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  72.76 
 
 
323 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  71.52 
 
 
323 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  69.04 
 
 
323 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  69.25 
 
 
323 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  63.16 
 
 
323 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  62.23 
 
 
323 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  60.06 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  62.54 
 
 
323 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  62.54 
 
 
323 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.92 
 
 
323 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.61 
 
 
323 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.61 
 
 
323 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  60.56 
 
 
323 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.92 
 
 
323 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  55.56 
 
 
311 aa  358  5e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  44.72 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  44.9 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  38.01 
 
 
456 aa  249  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  42.14 
 
 
309 aa  242  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.62 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.69 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  43.12 
 
 
483 aa  209  7e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  39.46 
 
 
465 aa  207  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.05 
 
 
320 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  37.2 
 
 
322 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
320 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
323 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
323 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
320 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
323 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
320 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
320 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.11 
 
 
320 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.74 
 
 
320 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.11 
 
 
320 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  33.75 
 
 
334 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.03 
 
 
322 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.22 
 
 
320 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
331 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  36.51 
 
 
320 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 
322 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
331 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
331 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.45 
 
 
320 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.39 
 
 
323 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.42 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  35.09 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.42 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  39.37 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 
322 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  37.63 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  38.33 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.96 
 
 
322 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.25 
 
 
322 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  36.21 
 
 
322 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  37.06 
 
 
313 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  38.96 
 
 
322 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  34.58 
 
 
325 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.58 
 
 
341 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  39.29 
 
 
322 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  39.12 
 
 
358 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  37.27 
 
 
323 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  37.63 
 
 
323 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.98 
 
 
322 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 
325 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.16 
 
 
322 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
323 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  36.59 
 
 
323 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  34.06 
 
 
325 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  36.59 
 
 
323 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  34.08 
 
 
322 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
323 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
323 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.15 
 
 
324 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.05 
 
 
324 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
370 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 
319 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
370 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 
319 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
370 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  36.77 
 
 
326 aa  189  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
370 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
370 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  38.33 
 
 
331 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.86 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.89 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  34.84 
 
 
348 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  35.07 
 
 
330 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
323 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  35.49 
 
 
322 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>