More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1248 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 323 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  65.94 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  57.32 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  53.61 
 
 		 322 aa  361  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  56.97 
 
 		 322 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  49.84 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.25 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.66 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  46.69 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47.32 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  46.69 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  47 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  46.69 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  46.3 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.49 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  40.71 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  40.71 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  41.87 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.42 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  37.25 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  40.07 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  35.49 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.74 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.67 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  36.42 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  35.8 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 322 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  34.28 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  34.94 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.7 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.94 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.42 
 
 		 337 aa  195  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.12 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.21 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 349 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.99 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  35.18 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  37 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.88 
 
 		 324 aa  192  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.42 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.22 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.22 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  37.36 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.67 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  38.06 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.49 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.66 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.27 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0899  Polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0021773  hitchhiker  0.000000547465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  32.49 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  35.85 
 
 		 323 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.33 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  36.67 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  35.24 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35.79 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 333 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.47 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  37.58 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  37.66 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.05 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  37.58 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  37.32 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  37.32 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.49 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.49 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.99 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  37.32 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>