More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0552 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 338 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  81.6 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  62.27 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  62.27 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  60.74 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  60 
 
 		 344 aa  350  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.98 
 
 		 331 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  60.8 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  56.57 
 
 		 333 aa  338  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  53.24 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  52.8 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.05 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  58.07 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  55.08 
 
 		 334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.6 
 
 		 337 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  53.68 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.9 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.78 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  53.66 
 
 		 344 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  52.66 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  52.66 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  52.66 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  53.92 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  51.53 
 
 		 335 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  51.37 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  50.46 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  50 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.23 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.38 
 
 		 335 aa  271  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  49.54 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.74 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  46.57 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  49.84 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.92 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.91 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  43.48 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.74 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.91 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.91 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.94 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.77 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.77 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.59 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.96 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.1 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.74 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  37.78 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.01 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.01 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  39.62 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.99 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  37.73 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.81 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.14 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.82 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.14 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.87 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.37 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.38 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.85 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.58 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.39 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  33.75 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.71 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.65 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  33.86 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  31.91 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  33.65 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  34.49 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  35.46 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  44.77 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  32.5 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.79 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  35.14 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>