More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4051 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 356 aa  696    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  88.95 
 
 		 344 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  62.39 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.54 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  60.47 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  64.29 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  61.09 
 
 		 331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.42 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  61.54 
 
 		 334 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  58.02 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  58.63 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  60.8 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  58.93 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  60.26 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.89 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  58.48 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.55 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  53.54 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  53.89 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.69 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  55.48 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  53.07 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  54.52 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  54.52 
 
 		 335 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  54.52 
 
 		 325 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  54.19 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  52.92 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.24 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  53.66 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.85 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  56.52 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.02 
 
 		 326 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  51.12 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  51.78 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.68 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  52.1 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  43.67 
 
 		 325 aa  209  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.94 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.1 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 		 322 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.15 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.13 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  38.66 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.44 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  36.22 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.98 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  34.29 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.66 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.21 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.92 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.21 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.26 
 
 		 318 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.97 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.2 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.97 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  35.96 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  45.16 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  33.87 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.54 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  31.85 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  32.7 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.45 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.21 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.99 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  37.5 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.33 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  33.11 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.94 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.37 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.94 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  34.49 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.34 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  34.77 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.77 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  34.01 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.09 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>