More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3215 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 334 aa  640    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  63.5 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  61.4 
 
 		 336 aa  360  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.06 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  60.8 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  61.3 
 
 		 367 aa  351  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  61.16 
 
 		 343 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  60.54 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.74 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  52.47 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  54.46 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  53.35 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.28 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  50.3 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.99 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.24 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  50 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  49.09 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  51.78 
 
 		 356 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.46 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.17 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  49.54 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  49.54 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.93 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.43 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  47.85 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  47.71 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  47.71 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  47.4 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.68 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  46.18 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  46.18 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  46.18 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  47.92 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.01 
 
 		 326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.74 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.04 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  42.17 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.09 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  40 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.31 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  31.65 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.81 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  34.86 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  36.77 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  34.46 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.21 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  34.56 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.31 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  32.82 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.97 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  38.58 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.67 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.89 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  38.17 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.09 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.09 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.08 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  36.12 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  31.19 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.08 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.2 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  37.13 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  32.07 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  38 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  35.59 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.83 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.52 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.69 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.99 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.48 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  34.01 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  32.44 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  32.44 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  32.44 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  32.44 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.85 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.64 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.05 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  31.03 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  30.84 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.32 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.27 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.03 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.56 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>