More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1350 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 318 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.32 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  58.13 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  50.16 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  49.84 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  44.79 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.19 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.55 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  45.79 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 323 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 323 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.96 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.01 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.69 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.35 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  37.19 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  38.24 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  39.54 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.89 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  39.54 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.85 
 
 		 322 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  34.92 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  38.54 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  35.24 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.83 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  36.71 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.13 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  35.24 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.31 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.82 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  38.24 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  35.24 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  34.94 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  34.7 
 
 		 323 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  36.21 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  35.96 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.03 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.02 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  37.01 
 
 		 322 aa  188  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 356 aa  188  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.92 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  36.99 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.58 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.62 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.7 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  37.19 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.99 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.78 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  36.89 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  37.78 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0899  Polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0021773  hitchhiker  0.000000547465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.22 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  37.22 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  35.11 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  35.11 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  35.11 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  35.65 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.2 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.38 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  37.7 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.49 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.85 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  34.48 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  37.7 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  37.7 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.24 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  34.8 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.88 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  34.48 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  36.77 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  38.26 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  33.75 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.06 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.81 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.08 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>