More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1038 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  100 
 
 
319 aa  652    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  76.42 
 
 
319 aa  501  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  76.42 
 
 
319 aa  501  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  44.41 
 
 
320 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  44.73 
 
 
320 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.31 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.31 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.63 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.99 
 
 
320 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.99 
 
 
323 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.67 
 
 
323 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.67 
 
 
323 aa  268  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.67 
 
 
320 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.67 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.67 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.35 
 
 
320 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.09 
 
 
321 aa  232  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.87 
 
 
323 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.14 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  36.19 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  37.74 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  40.54 
 
 
322 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  38.61 
 
 
322 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 
320 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  36.08 
 
 
318 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.36 
 
 
323 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 
318 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.02 
 
 
323 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.02 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.2 
 
 
323 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  32.99 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.19 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.02 
 
 
326 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.68 
 
 
323 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.01 
 
 
324 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  35.15 
 
 
326 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  37.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.59 
 
 
323 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.15 
 
 
323 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  31.35 
 
 
326 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  31.95 
 
 
323 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  31.75 
 
 
323 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  30.99 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  30.99 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.15 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.03 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.02 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  32.81 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.86 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  34.25 
 
 
323 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.22 
 
 
323 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
324 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.86 
 
 
338 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  31.63 
 
 
323 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  31.41 
 
 
327 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31.38 
 
 
321 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_002978  WD0799  octaprenyl-diphosphate synthase  34.08 
 
 
328 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  32.03 
 
 
326 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  30.65 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  31.76 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  35.46 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.16 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  29.55 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  29.75 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  30.46 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  31.72 
 
 
323 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  30.09 
 
 
326 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  31.53 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  30.96 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
370 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
370 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
370 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
370 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
370 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.9 
 
 
337 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  29.43 
 
 
323 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  31.86 
 
 
348 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  30.88 
 
 
345 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  29.1 
 
 
323 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  29.1 
 
 
323 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  29.1 
 
 
323 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  28.34 
 
 
334 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  29.1 
 
 
323 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  29.1 
 
 
323 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  29.1 
 
 
323 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  30.77 
 
 
323 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  28.76 
 
 
323 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  34.04 
 
 
337 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  32.38 
 
 
331 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  32.3 
 
 
323 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  28.48 
 
 
322 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  28.48 
 
 
322 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  29.67 
 
 
345 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  32.42 
 
 
332 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.85 
 
 
322 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  30.67 
 
 
329 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.56 
 
 
322 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.45 
 
 
323 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  30.77 
 
 
323 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>