More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0470 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  100 
 
 
320 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  75.31 
 
 
320 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  62.5 
 
 
320 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  61.88 
 
 
320 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  61.56 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  61.56 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  61.25 
 
 
320 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  60.94 
 
 
323 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  60.94 
 
 
323 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  60.62 
 
 
323 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  60.94 
 
 
320 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  60.94 
 
 
320 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  60.94 
 
 
320 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  46.86 
 
 
320 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.3 
 
 
323 aa  291  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  44.73 
 
 
319 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  44.09 
 
 
319 aa  289  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  44.09 
 
 
319 aa  289  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  47.2 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.96 
 
 
321 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  45.79 
 
 
318 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  43.79 
 
 
322 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  43.53 
 
 
322 aa  255  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.41 
 
 
320 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  36.63 
 
 
318 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  42.49 
 
 
338 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  37.74 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  36.04 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.24 
 
 
326 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
322 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  36.76 
 
 
323 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.65 
 
 
332 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  37.81 
 
 
323 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  37.38 
 
 
333 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.62 
 
 
333 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.62 
 
 
333 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  36.45 
 
 
323 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.31 
 
 
326 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.26 
 
 
345 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  36.99 
 
 
323 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  37.3 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  37.3 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  38.28 
 
 
332 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  39.94 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.65 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  36.93 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  36.05 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  38.36 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  38.34 
 
 
323 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.54 
 
 
323 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  36.16 
 
 
326 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.38 
 
 
323 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.75 
 
 
322 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.71 
 
 
322 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.22 
 
 
323 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.14 
 
 
323 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.66 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.12 
 
 
331 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.75 
 
 
322 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.62 
 
 
322 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.83 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  39.66 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 
343 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.51 
 
 
324 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.67 
 
 
333 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 
323 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  37.62 
 
 
349 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  36.34 
 
 
333 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  37.06 
 
 
323 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  36.34 
 
 
333 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  32.61 
 
 
326 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  32.52 
 
 
322 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.84 
 
 
323 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 
338 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.82 
 
 
337 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.28 
 
 
322 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.71 
 
 
336 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.95 
 
 
322 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 
323 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  31.56 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  37.62 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.13 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  34.47 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  36.83 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.28 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  35.44 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 
323 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.54 
 
 
334 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.33 
 
 
323 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.41 
 
 
334 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  32.21 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  37.58 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.86 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.83 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  35.8 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  35.13 
 
 
322 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.23 
 
 
322 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.56 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>