More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18951 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  100 
 
 
323 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  81.11 
 
 
323 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  82.66 
 
 
323 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  82.66 
 
 
323 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  74.61 
 
 
323 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  74.61 
 
 
323 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  73.99 
 
 
323 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  73.6 
 
 
323 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  76.16 
 
 
323 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  76.16 
 
 
323 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  65.53 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  59.94 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  63.47 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  61.92 
 
 
323 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  61.3 
 
 
323 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  61.3 
 
 
323 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  61.3 
 
 
323 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  61.3 
 
 
323 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  52.06 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  44.83 
 
 
325 aa  245  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  41.52 
 
 
332 aa  233  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  35.54 
 
 
456 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  40.63 
 
 
309 aa  207  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  42.64 
 
 
483 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.17 
 
 
322 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.05 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.73 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.73 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.73 
 
 
320 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.73 
 
 
320 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.73 
 
 
320 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  39.45 
 
 
323 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.41 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.98 
 
 
320 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.41 
 
 
320 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.97 
 
 
322 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.41 
 
 
320 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.96 
 
 
322 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.25 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  37.28 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.56 
 
 
322 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.87 
 
 
322 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.41 
 
 
320 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  38.18 
 
 
465 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  34.19 
 
 
322 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  36.93 
 
 
331 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.92 
 
 
322 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.26 
 
 
322 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  38.62 
 
 
344 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.93 
 
 
331 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.93 
 
 
331 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.93 
 
 
331 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.12 
 
 
320 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.01 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.21 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  36.59 
 
 
323 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 
322 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.74 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.08 
 
 
323 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35.89 
 
 
323 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 
323 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
370 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
370 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
370 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.75 
 
 
332 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
370 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35.89 
 
 
323 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
370 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  33.68 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 
323 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  35.4 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  37.85 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  32.78 
 
 
319 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  32.78 
 
 
319 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  33.44 
 
 
332 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 
358 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.05 
 
 
333 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  37.28 
 
 
331 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 
323 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
323 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 
313 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  36.48 
 
 
322 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  35.6 
 
 
325 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  34.24 
 
 
351 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 
322 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  38.61 
 
 
325 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  36.7 
 
 
322 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  35.14 
 
 
349 aa  175  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.836554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>