More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0680 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 322 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  49.53 
 
 		 320 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.84 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  44.79 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  44.72 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  46.27 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  45.17 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.57 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.53 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.96 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.27 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.96 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.96 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.32 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  40.93 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.91 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  37.17 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  37.62 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  36.31 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  37.81 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.42 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.41 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.05 
 
 		 324 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.22 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  33.97 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  36.88 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.76 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  36.73 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  36.73 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  35.94 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  36.11 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  35.88 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.12 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  32.06 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.95 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  34.58 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  34.69 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  35.69 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.19 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.35 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 358 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.93 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.38 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  34.19 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  38.41 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  32.59 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.59 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  34.82 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.69 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  32.19 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.09 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  33.76 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  36.31 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  36.7 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.69 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  35.81 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.98 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  34.63 
 
 		 331 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  36.84 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  33.55 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  36.7 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.82 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  31.11 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  34.52 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  32.18 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  33.53 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>