More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1188 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 324 aa  652    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  79.63 
 
 		 324 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  75.31 
 
 		 324 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  74.07 
 
 		 324 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  73.15 
 
 		 324 aa  494  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  71.3 
 
 		 324 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  70.06 
 
 		 324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.07 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  52.32 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  50.15 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.78 
 
 		 321 aa  308  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.29 
 
 		 323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  46.54 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  45.19 
 
 		 311 aa  298  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  44.24 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  39.75 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  41.55 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  39.43 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.98 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  38.98 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  39.51 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  37.25 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  37.67 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.35 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.91 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  34.97 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  37.33 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.5 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  37 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  36.09 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.62 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.35 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.38 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  34.88 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.62 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  36.71 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  36.33 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  35.8 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.77 
 
 		 333 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.65 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  34.37 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  38.97 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.24 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  37.62 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  34.66 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  34.66 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  34.46 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  34.88 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.08 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.87 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  34.37 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  37.58 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  33.75 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  35 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  34.46 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  35.38 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  35.79 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  37.37 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  34.06 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.9 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.56 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  33.85 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.72 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  36.67 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  36.67 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  36.67 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  33.85 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  34.88 
 
 		 327 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.81 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>