More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6988 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 321 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  65.09 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.84 
 
 		 324 aa  404  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  60.06 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  61.17 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.83 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  59.56 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  60.94 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  50.78 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  52.98 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  47.98 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  49.68 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  48.73 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  47.47 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  47.15 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  39.56 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.25 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  37.69 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  39.37 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  38.85 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  38.54 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  36.84 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.5 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.34 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.92 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.33 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.33 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  38.41 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  36.67 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.06 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  33.95 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  36.54 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.66 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.15 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  38.28 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.66 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.9 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.9 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.61 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.79 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.47 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.9 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.96 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.28 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  30.75 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.51 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  32.61 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  31.89 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.56 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  32.52 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  32.3 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  34.38 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  32.61 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  30.12 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.6 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  32.6 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  32.51 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.99 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  32.51 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.48 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.61 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.92 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.13 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  35.88 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.74 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  31.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  36.92 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  35.18 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  31.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>