More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2276 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 326 aa  667    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  67.91 
 
 		 326 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.42 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  62.19 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  62.07 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  62.06 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.94 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.5 
 
 		 323 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  50.15 
 
 		 324 aa  331  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  49.38 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  48.46 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  48.14 
 
 		 324 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  47.84 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  50.47 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  37.46 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 322 aa  225  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.94 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.11 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.09 
 
 		 335 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  36.71 
 
 		 322 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 322 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  36.48 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.39 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36.39 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.76 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.74 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  35 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  36.42 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  36.31 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.4 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.76 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.64 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.71 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.71 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  35.35 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  36.05 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.03 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.75 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.38 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.72 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  33.75 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.24 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  32.82 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  32.82 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.75 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.35 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  34.59 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.92 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  32.09 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  34.71 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  31.15 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  34.88 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  32.52 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.61 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  33.94 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.86 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  35.09 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  36.05 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  34.78 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  30.67 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  34.15 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  34.16 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.92 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  32.61 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  33.85 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  33.85 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  33.85 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  33.85 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  33.85 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  33.85 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.3 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  34.07 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>