More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1784 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  100 
 
 
325 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  81.85 
 
 
326 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  79.42 
 
 
311 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.19 
 
 
324 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  62.5 
 
 
326 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.06 
 
 
321 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  62.07 
 
 
326 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  58.57 
 
 
323 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  46.93 
 
 
324 aa  310  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  46.25 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  47.65 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  46.01 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  44.17 
 
 
324 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  44.24 
 
 
324 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  45.74 
 
 
324 aa  295  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  42.94 
 
 
324 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  38.85 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  38.98 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  39.42 
 
 
322 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  38.67 
 
 
292 aa  217  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  38.19 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.02 
 
 
322 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  36.51 
 
 
322 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.28 
 
 
334 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  36.93 
 
 
322 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.33 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  35.78 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.6 
 
 
322 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.48 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36.27 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  36.54 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.17 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  36.54 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.65 
 
 
333 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 
332 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.65 
 
 
333 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.94 
 
 
322 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  33.66 
 
 
331 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.09 
 
 
332 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  36.6 
 
 
360 aa  192  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  36 
 
 
322 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.32 
 
 
333 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32.5 
 
 
336 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 
331 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.16 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  32.73 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.65 
 
 
348 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  34.22 
 
 
337 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  32.39 
 
 
341 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 
323 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 
331 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 
331 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 
331 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 
345 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  35.67 
 
 
331 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  34.49 
 
 
323 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  32.39 
 
 
358 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.31 
 
 
320 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  31.11 
 
 
340 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 
331 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 
337 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  33.02 
 
 
323 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  34.76 
 
 
321 aa  185  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  32.69 
 
 
322 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  34.63 
 
 
317 aa  185  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.5 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.05 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 
370 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 
370 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  30.48 
 
 
340 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 
370 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 
370 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 
370 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  36.33 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  35.83 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  33.02 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  33.87 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  33.87 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  34.44 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  33.65 
 
 
325 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 
323 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  32.81 
 
 
322 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  33.55 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  33.55 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  33.55 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  33.55 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>