More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0775 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  660    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  42.71 
 
 
326 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  38.18 
 
 
311 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.47 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  38.8 
 
 
326 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.81 
 
 
321 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  41.55 
 
 
324 aa  235  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  38.85 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  42.45 
 
 
332 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  41.86 
 
 
324 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  39.62 
 
 
324 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  38.98 
 
 
324 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  40.14 
 
 
324 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  40.85 
 
 
324 aa  222  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  37.46 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.8 
 
 
323 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.28 
 
 
322 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.84 
 
 
322 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
322 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.63 
 
 
322 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  34.3 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  34.3 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  33.98 
 
 
322 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.5 
 
 
322 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  37.5 
 
 
334 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  35.83 
 
 
340 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 
332 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 
322 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.66 
 
 
322 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 
334 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  34.3 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.82 
 
 
333 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.82 
 
 
333 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.04 
 
 
322 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.92 
 
 
338 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  36.25 
 
 
323 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  34.82 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.4 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.95 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.82 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.95 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  32.58 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  32.79 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.7 
 
 
333 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  30.87 
 
 
328 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  32.27 
 
 
322 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.99 
 
 
322 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.79 
 
 
336 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 
345 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  33.21 
 
 
322 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.95 
 
 
322 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  33.69 
 
 
334 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  35.13 
 
 
331 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  35.13 
 
 
331 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.53 
 
 
322 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  35.13 
 
 
331 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  33.46 
 
 
332 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  35.13 
 
 
331 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  35.76 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  32.65 
 
 
360 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.97 
 
 
348 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  34.12 
 
 
337 aa  165  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  37.84 
 
 
359 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.66 
 
 
320 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  31.76 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.87 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.3 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  35.13 
 
 
292 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  31.68 
 
 
341 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 
323 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  31.42 
 
 
340 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.22 
 
 
333 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.65 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  35.29 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  35.29 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  31.54 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.84 
 
 
323 aa  162  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.65 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 
322 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  32.64 
 
 
322 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  30.41 
 
 
345 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  30.23 
 
 
356 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.15 
 
 
343 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.24 
 
 
345 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33 
 
 
325 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.65 
 
 
323 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 
323 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  29.9 
 
 
340 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  30.07 
 
 
345 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 
323 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 
331 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 
323 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.23 
 
 
323 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.45 
 
 
333 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  36 
 
 
317 aa  159  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  31.13 
 
 
336 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  31.73 
 
 
322 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>