More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0545 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 323 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  63.24 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.12 
 
 		 324 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.83 
 
 		 321 aa  414  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  58.15 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  59.09 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  59.06 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  58.44 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  48.91 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  52.02 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  50.47 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  47.98 
 
 		 324 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  49.22 
 
 		 324 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  47.04 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  48.6 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  46.73 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.2 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.24 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.97 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.24 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.24 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  35.09 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.16 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.78 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.69 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.5 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.16 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.16 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  34.26 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  40.57 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.7 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  42.61 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  40.74 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.39 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  34.71 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  32.71 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  34.08 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.4 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  32.71 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.4 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.69 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.74 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  34.5 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  32.4 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.21 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.89 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  34.19 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.92 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.08 
 
 		 320 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 		 337 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.34 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  31.31 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  31.56 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  34.7 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  34.41 
 
 		 337 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.69 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  33.75 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  36.47 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.69 
 
 		 320 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.69 
 
 		 320 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  35.57 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.87 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.87 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  32.69 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  38.52 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  39.34 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  36.08 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.21 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.21 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.08 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>