More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1998 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 292 aa  590  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 326 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.79 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  38.67 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  42.14 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.71 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  38.97 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  37.81 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  39.64 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  38.38 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  38.21 
 
 		 324 aa  191  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  39.08 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  38.87 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  39.18 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  38.6 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.79 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.43 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.56 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  38.81 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.27 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  37.89 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  37.28 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.86 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  37.46 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.21 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.5 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  36.91 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  38.28 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  38.28 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  38.28 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.19 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.71 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 		 339 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.46 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.46 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.83 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  34.51 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  35.96 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  37.37 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.89 
 
 		 343 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 340 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.34 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  36.33 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  34.49 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0238  polyprenyl synthetase family protein  35.69 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0405378  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  35.13 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  36.71 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.64 
 
 		 322 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.93 
 
 		 332 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  36.88 
 
 		 332 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  36.88 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  35.66 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  33.9 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.99 
 
 		 322 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  34.97 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.34 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36.62 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.76 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  40.19 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  34.98 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.44 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  36.17 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  34.01 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  35.66 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  36.27 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.64 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  35.31 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  34.71 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>