More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0904 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 317 aa  642    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  98.42 
 
 		 317 aa  631  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  94.01 
 
 		 317 aa  607  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  81.39 
 
 		 317 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  71.29 
 
 		 320 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  44.82 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  42.81 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  41.28 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  42.05 
 
 		 327 aa  221  8e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  39.81 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  39.63 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  39.94 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.85 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  37.19 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  37.22 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  35.65 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  41.08 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  37.29 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 348 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  37.06 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  37.15 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  39.31 
 
 		 349 aa  178  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  36.78 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.18 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  35.53 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  39.38 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  38.43 
 
 		 325 aa  168  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.42 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.87 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  35.36 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  36.43 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  36.43 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  36.98 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.45 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.79 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  40.55 
 
 		 294 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  37.36 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.41 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  36.6 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  31.46 
 
 		 323 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  36.68 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  35.18 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.24 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.71 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.71 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.71 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.71 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.71 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  34.25 
 
 		 359 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.65 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  37.88 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.81 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.71 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.09 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.49 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.4 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  32.34 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  31.19 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.66 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.8 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  35.64 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.93 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.15 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.46 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  32.36 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.39 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.48 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.48 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.36 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  32.25 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.78 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  30.79 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>