More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2608 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 344 aa  683    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  72.38 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  73.43 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  72.38 
 
 		 349 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  64.29 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  47.16 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  47.16 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  45 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  42.73 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  43.9 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  44.41 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  41.96 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.53 
 
 		 317 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  34.62 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  39.06 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.06 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  37.58 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  35.61 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  34.2 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  32.95 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  33.43 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.72 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38.68 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  32.27 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  34.27 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.14 
 
 		 326 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  29.94 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.88 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  39.91 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  36.26 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.63 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  32.52 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  30.54 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.14 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.34 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.8 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  31.71 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  30.84 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  30.84 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  31.4 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.24 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.93 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.35 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.05 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  31.7 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.01 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  29.55 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32.12 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  30.72 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  29.76 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.87 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  32.65 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  38.58 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  31 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  32.12 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  32.37 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  32.37 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  35.59 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  28.96 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.52 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  31.1 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  31.1 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  31.69 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.82 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  31.1 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  29.82 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  31.1 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  31.1 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.1 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  36.57 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.61 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  31.1 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.56 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  35.44 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  30.39 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.1 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  37.09 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>