More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2538 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  100 
 
 		 349 aa  694    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  85.1 
 
 		 349 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  69.91 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  72.38 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  70.38 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  47.79 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  49.26 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  45.72 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  48.23 
 
 		 321 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  45.63 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  45.19 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  44.41 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  42.63 
 
 		 320 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  40 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  39.56 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  39.31 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  39.31 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  33.43 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.08 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  31.69 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  32.02 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  37.45 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  39.33 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  34.37 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  32.85 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  33.04 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  37.69 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.84 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.52 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30.72 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.53 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.94 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  39.57 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  35.71 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.84 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.31 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.65 
 
 		 320 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.75 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.94 
 
 		 331 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  31.32 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  33.71 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.9 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  30.86 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.06 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.82 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  33.88 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.76 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  31.7 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  30.45 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.28 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  30.93 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  30.79 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.97 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  30.5 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  37.83 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.05 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.7 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  32.38 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.51 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  30.72 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  39.23 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  30.91 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  38.85 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  31.41 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  29.84 
 
 		 323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  29.75 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  30.49 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  30.53 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  39.77 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  30.84 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  32.47 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>