More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1628 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 322 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  50.77 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  50.77 
 
 		 323 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  49 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  48.77 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  45.74 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  45.6 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  44.95 
 
 		 323 aa  265  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  38.63 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  38.39 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  38.01 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  37.82 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  37.54 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  37.46 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  38.36 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  43.84 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  37.5 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  35.28 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  36.77 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  41.44 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  42.38 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  34.75 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  40.09 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.16 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  37.89 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  40.55 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.68 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.6 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  39 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 299 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.12 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  34.04 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  33.56 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.91 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.5 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  35.91 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  33.63 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  40.26 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  32.07 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.71 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.29 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  33.81 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  36.29 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.9 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  35.98 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  34.74 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  35.86 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  37.98 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.79 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  34.58 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  35.68 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.35 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  36.53 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  38.17 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  36.75 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.96 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.2 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.63 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  31.85 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  34.52 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.07 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  31.31 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  31.85 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.8 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  33.76 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  32.07 
 
 		 356 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  31.49 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  36.68 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.66 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  32.41 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  36.44 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  32.99 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  31.49 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  34.38 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>