More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1844 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 321 aa  657    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  54.94 
 
 		 324 aa  364  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  54.32 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  48.33 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  43.35 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  41.8 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  45.6 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  43.61 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  41.01 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  42.9 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  39.88 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  41.45 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  39.88 
 
 		 332 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  39.68 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  41.63 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  35.36 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  35.19 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  41.67 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  38.32 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32.53 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.12 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  36.07 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  37.23 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  38.26 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  37.83 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  33.89 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.07 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  30.72 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  32.87 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  29.11 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  37.61 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  33.69 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.65 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.76 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  34.02 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  34.83 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.78 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.09 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  36.22 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  31.34 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  39.63 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  34.09 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  34.28 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  39.17 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.84 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  31.86 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  37.82 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  34.88 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  38.06 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  31.27 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.14 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.94 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  34.11 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  34.38 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  34.23 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.01 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  35.68 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  34.41 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.19 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  35.68 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  33.58 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  36.23 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  34.68 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.82 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  34.72 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.01 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  36 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  33.73 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  30.21 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  33.47 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.05 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  32.43 
 
 		 358 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  35.06 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>