More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0150 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 334 aa  656    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  80.84 
 
 		 334 aa  546  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  81.74 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  80.24 
 
 		 334 aa  543  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  57.48 
 
 		 340 aa  364  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  47.92 
 
 		 337 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  34.32 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  36.24 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  34.3 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  29.22 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  34.83 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  33.65 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  35.58 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 338 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.29 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.33 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  37.5 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.33 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  32.11 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.23 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  29.67 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.79 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  31.04 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.15 
 
 		 364 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  30.92 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  28.71 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.41 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  29.93 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  32.33 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  32.89 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  29.51 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  29.66 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.84 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  30 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  29.37 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  29.45 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  28.71 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  28.74 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  30.87 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  34.19 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  30.87 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.06 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  30.88 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  35.34 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  31.68 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.54 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.44 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  30.55 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  32.07 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  29.24 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.63 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.23 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  30.46 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  33.21 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  31.93 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.32 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.9 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 346 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  33.47 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  30.55 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  32.27 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  31.63 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  30.39 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.45 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  37.3 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>