More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1264 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  47.97 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.78 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.54 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  49.82 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  47.18 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  48.64 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 300 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  45.61 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  44.52 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  47.81 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.73 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  45.39 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.39 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  48.51 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  48.13 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  49.48 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  49.23 
 
 		 301 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  46.78 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  48.17 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  44.93 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.41 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.7 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  45.89 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  44.9 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.58 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  46.28 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  45.59 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.84 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  46.96 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.88 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  45.3 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.67 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  43.92 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  42.55 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  43.57 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  46.75 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.02 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  46.74 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  42.91 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  43.42 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  43.49 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  39.8 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  45.67 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.57 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  44.7 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  40.61 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  41.31 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  41.31 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  44.7 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.21 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  40.6 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  40.3 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  40.07 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  40.07 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  40.53 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  40.07 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  40.82 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  45.33 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  40.41 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  41.22 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  39.73 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  39.73 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  39.73 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  39.73 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  44.49 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.39 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  42.05 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3822  polyprenyl synthetase  43.63 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50228  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.39 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  42.05 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>