More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0312 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 326 aa  663    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  37.69 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  39.81 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  38.13 
 
 		 317 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.33 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  38.18 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.09 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  37.65 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  36.56 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  33.03 
 
 		 321 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  34.45 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  41.15 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.45 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.78 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  34.96 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  32.81 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  36.9 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  32.34 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  32.53 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.97 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  35.36 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.1 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  31.36 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  34.54 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  37.87 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  34.97 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  34.04 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  35.98 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  29.72 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  28.66 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  30.16 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  31.9 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.71 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  31.11 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.41 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  33.84 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  32.74 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  29.71 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  30.53 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.22 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  28.48 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  29.91 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  29.91 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  29.91 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.68 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  31.25 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  34.22 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  30.09 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  28.75 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  29.6 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  30.84 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  29.56 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  29.78 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  29.28 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  35.76 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  29.39 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  34.02 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  30.91 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  35.07 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  28.66 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  31.8 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  30.67 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.67 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  29.87 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  28.75 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  31.82 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  31.13 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  28.66 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  29.41 
 
 		 320 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  33.01 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.99 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  27.81 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  36.46 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  30.39 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  36.52 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  30.03 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  30.35 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  28.43 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>