More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1263 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 324 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  66.67 
 
 		 324 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  54.32 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  49 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  44.97 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  44.19 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  43.38 
 
 		 323 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  42.9 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  40.13 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  38.01 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  36.75 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  38.28 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  35.97 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  37.13 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  38.62 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.27 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  38.96 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  39.32 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  39.19 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.2 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  37.87 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  38.93 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  35.56 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  34.37 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  34.31 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  40 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  37.73 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.67 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  32.79 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  35.03 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  32.41 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  41.92 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.85 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.11 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.81 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.32 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  34.92 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  35.25 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  33.72 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.7 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  33.93 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  35.8 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  37.89 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  33.57 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  34.7 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  31.21 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.13 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  34.22 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39.41 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  34.22 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  36.55 
 
 		 298 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  35.34 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  35.98 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  34.03 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  30.04 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.66 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.66 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  36.13 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.46 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  33.2 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  35.71 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  32.45 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  28.26 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.78 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  33.62 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  36.41 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  30.48 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.73 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>