More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2704 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 309 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  73.47 
 
 		 320 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  69.8 
 
 		 307 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  66.67 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  66.67 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  69.31 
 
 		 316 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  67.22 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  59.8 
 
 		 299 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  57.43 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  59.46 
 
 		 299 aa  351  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  60.9 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  60.55 
 
 		 300 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  58.84 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  57.62 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  60.21 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  58.84 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  59.8 
 
 		 296 aa  322  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  59.8 
 
 		 296 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  54.21 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 295 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  51.53 
 
 		 295 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  50.85 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  51.36 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  51.68 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 294 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  50 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  51.01 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 297 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50.56 
 
 		 295 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  51.85 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  47.3 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  44.11 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.3 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  48.13 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  44.93 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  48.15 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.69 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  42.91 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.03 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.43 
 
 		 290 aa  225  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  45.28 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  46.76 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  40.96 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  46.76 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  42.76 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  42.53 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  42.14 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  46.47 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  41.77 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  44.22 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  42.07 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  46.86 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  42.07 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  48.7 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  42.61 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.15 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  46.94 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  46.94 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  45.63 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  45.02 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  40.41 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  41.3 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  49.06 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  38.82 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  42.44 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  45.9 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  45.9 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  38.49 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  46.26 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  44.1 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  49.81 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  41.24 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  43.82 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  45.83 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  44.75 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  39.4 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>