More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0776 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  67.58 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  67.22 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  66.55 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  64.97 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  64.97 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  65.19 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  63.39 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  64.6 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  64.26 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  61.86 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  60.82 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  66.33 
 
 		 296 aa  363  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  62.07 
 
 		 300 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  62.07 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  61.2 
 
 		 306 aa  361  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  61.03 
 
 		 300 aa  358  4e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  64.95 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  54.3 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  56.46 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  57.29 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  54.42 
 
 		 296 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  56.42 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  54.73 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  52.56 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  52.38 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  55.7 
 
 		 297 aa  298  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  55.41 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  55.03 
 
 		 297 aa  291  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  51.86 
 
 		 294 aa  285  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  55.25 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.81 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  46.67 
 
 		 315 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50.57 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.67 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  47.65 
 
 		 296 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  47.65 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  47.24 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  52.22 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  48.63 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  46.26 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  44.71 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  45.18 
 
 		 301 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  47.14 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.37 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  44.97 
 
 		 306 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  46.62 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.11 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  47.41 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  48.99 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  48.99 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  47.46 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  48.4 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.74 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.48 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  48.64 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  48.47 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.61 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  47.19 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43.54 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.14 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.54 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.85 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.49 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.61 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  48.62 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  47.26 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  43.45 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  43.92 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  47.95 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  46.84 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  46.84 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  46.84 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  48.37 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  52.65 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>