More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1004 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  51.33 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  47.32 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  49.44 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  48.7 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  43.69 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 306 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  45.58 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  42.18 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  42.23 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  42.23 
 
 		 300 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  42.18 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  43.46 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  44.71 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.84 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.84 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.28 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.27 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  44.93 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  43.6 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  40.83 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  43.11 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.2 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  41.5 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  40.89 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  42.01 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  39.8 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  44.24 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.64 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  45.74 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  38.76 
 
 		 312 aa  208  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  43.82 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  41.1 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  41.39 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  46.48 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  40.74 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  42.01 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  42.25 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  41.2 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  39.4 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.01 
 
 		 337 aa  199  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  39.07 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  44.36 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  38.54 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  39.25 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  40.94 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.25 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  38.54 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  39.81 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  41.08 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  43.07 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  43.07 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  39.53 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.59 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2250  hypothetical protein  40.07 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  41.61 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  41.61 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  41.61 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  41.61 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  41.61 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  41.46 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2278  hypothetical protein  40.07 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  38.05 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  40.21 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  36.88 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  40.13 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  40.83 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  43.07 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  37.37 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  36.88 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  41.03 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  42.49 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  41.22 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  39.39 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  35.43 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  39.74 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  40.48 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  37.17 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>