More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0955 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 298 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  60.87 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  61.02 
 
 		 295 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0125  Polyprenyl synthetase  59.42 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.503907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  61.62 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  48.64 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  58.84 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  52.05 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  51.71 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  54.51 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  50.84 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  49.48 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  51.9 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  51.9 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  52.5 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  49.63 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  47.6 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  49.16 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  50.52 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  47.94 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  47.22 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  47.74 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  44.71 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  51.7 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  48.97 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  51.02 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  50.89 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  53.16 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  51.71 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  49.22 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  51.36 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  51.77 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  50 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  50.18 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  52.42 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.63 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  46.42 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  47.1 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  47.35 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  45.54 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  49.25 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  49.63 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  48.29 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  50.74 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  46.47 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  49.65 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.2 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  46.02 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  50.37 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  49.45 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  49.8 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  50.37 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  45 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  49.63 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  49.82 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  48.14 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  49.08 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  49.08 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  47.17 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  45.06 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  42.7 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  49.08 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  48.14 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  49.26 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  45.64 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  49.25 
 
 		 321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  47.72 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.96 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  48.52 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3822  polyprenyl synthetase  47.65 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50228  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  48.95 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  46.82 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  44.29 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  43.94 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  43.94 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  48.42 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  46.74 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  47.78 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>