More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3822 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3822  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 325 aa  638    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50228  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.3 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 300 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.41 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  43.52 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  46.33 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  43.83 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  42.59 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  46.98 
 
 		 297 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  40.12 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.41 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  43.57 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  38.51 
 
 		 312 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  42.02 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  42.41 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.07 
 
 		 297 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.02 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  47.65 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  46.3 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  37.73 
 
 		 316 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  41.67 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  40.53 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 		 296 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  41.8 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  36.54 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  36.21 
 
 		 290 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  38.78 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  43.38 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.67 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  39.2 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  41.8 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  41.77 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  47.12 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  44.85 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  41.39 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  42.26 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  41.72 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  42.26 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  41.88 
 
 		 296 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  44.82 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  38.77 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  39.88 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  41.03 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  43.36 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  43.73 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  43.73 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.96 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  40.24 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  39.46 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  43.41 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  43.21 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  42.06 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  44.21 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  43.51 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  44.63 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  47.99 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  41.91 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  44.09 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2228  polyprenyl synthetase  39.74 
 
 		 360 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 334 aa  185  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  42.09 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 295 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  44.09 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  42.52 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  33.75 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>