More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1705 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  81.58 
 
 		 300 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  55.3 
 
 		 297 aa  301  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  55.67 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  53.49 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  56.52 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  55.18 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  55.52 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  55.18 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  55.18 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  55.18 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  54.7 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  55 
 
 		 293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  55.41 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  52.03 
 
 		 292 aa  285  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  51.17 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  57.38 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  53.16 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.38 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  55 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  59.7 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  55.03 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  49.49 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  58.85 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  52.61 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  50.98 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  48.82 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  48.45 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  55.33 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  50.89 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  48.22 
 
 		 306 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  48.22 
 
 		 306 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  49.14 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  50.89 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  52.07 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  51.49 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  49.67 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  50.33 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  54.51 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  49.18 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  50.92 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  49.17 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  47.6 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  49.16 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  45.93 
 
 		 322 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  45.42 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  45.42 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  52.03 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  44.08 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  44.67 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  46.73 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  45.39 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.65 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.29 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  52.3 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.83 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  43.09 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  43.33 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  50.35 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  50.69 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  50.85 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  48.23 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  43.67 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  50.89 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  45.3 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  50.89 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.86 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  49.14 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  51.66 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>