More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1746 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  84.64 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  72.61 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  68.71 
 
 		 297 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  72.45 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  73.67 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  67.99 
 
 		 314 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  69.93 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  69.59 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  63.36 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2014  farnesyl-diphosphate synthase  72.88 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319627  hitchhiker  0.00305409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  59.12 
 
 		 293 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  58.78 
 
 		 294 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  58.78 
 
 		 293 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  57.43 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  57.43 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  57.43 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  57.43 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  57.09 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  57.43 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  57.43 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  58.45 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  56.07 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  54.36 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  52.77 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  51.19 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  59.31 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.4 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  53.58 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  55.89 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  54.18 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  57.89 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  57.89 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  56.6 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  52.67 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.79 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  51.33 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  58.73 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.58 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  56.76 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  57.65 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  51.18 
 
 		 295 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  55.06 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  55.6 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  55.22 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.56 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.62 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.23 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  47.55 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.63 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  52.68 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.11 
 
 		 300 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.75 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  48.21 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  46.3 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  49.32 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  42.19 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  45.58 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  45.58 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  51.52 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  45.58 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  45.86 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  48.54 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.07 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.58 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  48.94 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  55.6 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  49.67 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  47.08 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.79 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  40.79 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  43 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46.79 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  43.62 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  48.24 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  46.77 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 299 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  44.15 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.34 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  46.35 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>