More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2241 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  73.73 
 
 		 311 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  74.26 
 
 		 314 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  67.63 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  71.66 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  69.59 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  68.14 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  76.77 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  68.94 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2014  farnesyl-diphosphate synthase  73.77 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319627  hitchhiker  0.00305409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  66.98 
 
 		 314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  59.06 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  59.06 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  59.06 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  59.06 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  59.26 
 
 		 294 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  59.26 
 
 		 294 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  59.26 
 
 		 294 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  58.59 
 
 		 294 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  58.05 
 
 		 294 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  58.25 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  58.25 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  58.25 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  57.58 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  57.58 
 
 		 293 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  57.38 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  57.58 
 
 		 293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  58.92 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  55.41 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  54.24 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  53.07 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  56.23 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  55.59 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  58.28 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  56.71 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  52.25 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  57.77 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  60.07 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  50.65 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  57.33 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  56.63 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  53.28 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  60.92 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  48.32 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  54.1 
 
 		 298 aa  235  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  56.04 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  56.04 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  52.51 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  53.79 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.81 
 
 		 316 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  53.96 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  55.02 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  54.09 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  46.82 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  52.22 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  49.07 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  48.7 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  53.38 
 
 		 295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  48.7 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  53.58 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  53.38 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  53.36 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  49.67 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  55.02 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  45.18 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.08 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  45.13 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  52.42 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  48.2 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.95 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.95 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  46.67 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  43.33 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.67 
 
 		 291 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  41.86 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  41.33 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  48.61 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  47.33 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  46.15 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.95 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.3 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  50.68 
 
 		 285 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  42.14 
 
 		 312 aa  208  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  49.27 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  39.55 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.33 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.63 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  48.33 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  43.64 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>